Это старая версия документа!
Чтобы работали файлы .htaccess необходимо в конфигурационном файле /etc/apache2/apache2.conf
<Directory /var/www/>
Options Indexes FollowSymLinks
AllowOverride None
Require all granted
</Directory>
привести к виду
<Directory /var/www/>
Options Indexes FollowSymLinks
AllowOverride All
Require all granted
</Directory>
При этом нужно учитывать, что большое количество файлов .htaccess может замедлить работу сервера.